Свободные экономические зоны являются частью таможенной территории Республики Таджикистан.

Товары, помещенные на территории СЭЗ РТ, рассматриваются как находящиеся вне таможенной территории Республики Таджикистан, что позволяет ввозить товары из-за рубежа без уплаты импортной пошлины и НДС.

Ввоз на территорию СЭЗ иностранных и отечественных товаров, производственного и строительного оборудования осуществляется без взимания таможенных пошлин и налогов.

При вывозе товаров с территории СЭЗ за пределы Республики Таджикистан не взимаются налоги и таможенные пошлины, за исключением сборов за таможенное оформление, и не применяются запреты и ограничения экономического характера.

При вывозе товаров с территории СЭЗ товаров на территорию Таджикистана не взимаются таможенные пошлины, НДС оплачивается со стороны покупателя.

Определение страны происхождения по отношению к товарам, производимых в СЭЗ и ввозимых в нее, осуществляется в соответствии с законодательством Республики Таджикистан и международными правовыми актами, признанными Таджикистаном.